原核转录组测序基于高通量二代测序，去除rRNA后构建链特异性文库，可以研究特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括 mRNA和非编码RNA。通过原核转录组测序，可以进行基因的结构功能及表达调控研究， 具有广泛的应用前景。
RNA样品
菌体样品
比较转录组学研究泰地罗新抗性及敏感型副猪嗜血杆菌
Comparative transcriptional profiling of tildipirosin-resistant and sensitive Haemophilus parasuis
病原菌副猪嗜血杆菌（HPS）是最常见的革兰氏阴性菌，主要引起多发性浆膜炎和关节炎，造成全世界养猪业重大的经济损失。目前已有大量研究关注副猪嗜血杆菌耐药性的分子机制，但还很少开展泰地罗新相关研究。本研究的目的是使用RNA测序方法系统地分析了与JS 0135菌株相比泰地罗新的耐药菌（JS 32）的转录组和形态特征的转变响应。该项研究将有助于更好地理解在HPS的泰地罗新的耐药机制，后续合理利用泰地罗新开发预防或降低HPS的耐药性的新方法。
本研究主要结果如下：
1.生长曲线显示JS 32具有较高的生长速度，但是生物量相比JS 0135较少。
2.JS32与临床耐药菌株HB32的细胞膜相对JS 0135都较为平滑。
3.差异表达分析结果显示，JS32具有349个上调基因及113个下调基因，主要覆盖37个GO功能及63个KEGG通路，包括生物过程(11)、细胞成分(17)、分子功能(9)、细胞过程(1)、环境信息处理(4)、遗传信息处理(9)和代谢(49)。
4.发现相对过表达基因，包括代谢通路 (HAPS_RS09315, HAPS_RS09320)、核糖体(HAPS_RS07815)和ABC转运蛋白(HAPS_RS10945)。
结果展示：
Lei Z, Fu S, Yang B, et al. Comparative transcriptional profiling of tildipirosin-resistant and sensitive Haemophilus parasuis. Scientific Reports. 2017;7:7517. doi:10.1038/s41598-017-07972-5.
