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small RNA是生物体内一类重要的功能分子，主要包括miRNA、siRNA和piRNA。它们通过各种序列特异性的基因沉默作用，包括RNA干扰(RNAi)、翻译抑制、异染色质形成等，诱导基因沉默，调控诸如细胞生长发育、应激反应、沉默转座子等各种各样的细胞生理过程。小RNA利用第二代高通量测序技术，对某物种某组织在特定状态下的18-30nt（或18-40nt）的小RNA进行高通量测序，通过数据库比对进行信息分析。
small RNA测序揭示BRCA1相关的恶性浆液性卵巢癌的miRNA整体特征
Small RNA sequencing reveals a comprehensive miRNA signature of BRCA1-associated high-grade serous ovarian cancer
BRCA1突变携带者具有罹患恶性浆液性卵巢癌(HGSOC)的高风险， 患恶性浆液性卵巢癌是一种来源于输卵管上皮细胞的恶性肿瘤。本文为了鉴定BRCA1相关HGSOC 中的已知和新的miRNAs的差异表达。
本研究主要结果如下：
1.报道了一个BRCA1-相关的HGSOC中，已知的和新的miRNAs的整体表达特征。大部分miRNA和之前的研究报道想吻合，本文重点关注了一些新的miRNAs在HGSOC 中的差异表达。
2.对5个携带BRCA1的HGSOC患者和8个正常患者的输卵管进行small RNA 测序。对部分已知和未知的miRNA在用于测序的样本中和其它样本中进行qRT-PCR验证。利用TCGA中的数据，对已鉴定的miRNA进行临床数据的相关性分析。 结果：59个已知的和20个新的miRNA在正常和HGSOC中表现出大于4倍的显著性表达差异。qRT-PCR进一步验证了11个已知miRNAs中的10个的显著性差异表达。两个新miRNA的上调没有被证明。7个miRNAs 在绝经后的正常输卵管中表现出相对于绝经前的显著的上升。Expression levels of miR-145-5p的表达水平在育龄阶段显著的上升, 其它9个已验证的miRNAs的表达和临床数据没有相关性。
部分结果展示：
1）利用小RNA测序，鉴定出BRCA1相关HGSOC中已知的和新的差异表达得miRNA，150个已知的和30个新的miRNA表现出显著的差异，其中59个已知的和20个新的miRNA表现出4倍以上的差异。
图1. MiRNA差异表达的聚类。 79个miRNA显示出显著的4倍以上的差异表达
Brouwer, J., et al., Small RNA sequencing reveals a comprehensive miRNA signature of BRCA1-associated high-grade serous ovarian cancer. J Clin Pathol, 2016.
