主页 > 科技服务 > 转录调控测序 > circle RNA测序
环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子，也是RNA领域最新的研究热点。与传统的线性RNA(linear RNA，含5’和3’末端)不同，circRNA分子呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。在功能上，近年的研究表明，circRNA分子富含microRNA(miRNA)结合位点，在细胞中起到miRNA海绵(miRNA sponge)的作用，进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，升高靶基因的表达水平；这一作用机制被称为竞争性内源RNA(ceRNA)机制。通过与疾病关联的miRNA相互作用， circRNA在疾病中发挥着重要的调控作用。
外泌体circRNA 有望成为癌症诊断生物标记物
Circular RNA is enriched and stable in exosomes: a promising biomarker for cancer diagnosis
circRNA是一种可调控基因表达的内源性非编码RNA。表达模式具有细胞类型和发育时期特异性。外泌体是一种来自于多种细胞类型的内吞作用产生的小的膜泡结构，含有特定的蛋白、mRNA和microRNA，可以调控细胞行为，并且能够作为一些人类疾病的诊断标记。
本研究主要结果如下：
1.首次研究了外泌体中circRNA的种类数量。RNA-seq分析揭示了相对于来源细胞，circRNA富集在外泌体中。
2.外泌体中circRNA的选择可能是由来源细胞中的相关miRNA水平调控的，而且可能将生物活性传递给接受细胞。ircRNA的选择可能是由来源细胞中的相关miRNA水平调控的，而且可能将生物活性传递给接受细胞。
3.在人血清外泌体中鉴定出超过1000种circRNAs。癌症产生的circRNA进入血液循环能够在血清中检测到。血清外泌体中的circRNAs可用来对结肠癌患者进行检测。
结论：外泌体中的circRNA具有潜在的生物学功能，并且有望成为一种新的癌症检测标记物。
部分结果展示：
1）在细胞和外泌体中分别发现了5484、6751条circRNAs，exo-circRNA在外泌体中富集程度至少高于细胞2倍。分析结果显示外泌体相较细胞circRNA水平与线性RNA的比值显著升高约6.3倍。
图1. 细胞中和细胞的外泌体中circRNAs的表达情况以及circRNAs在外泌体中显著富集
2）人血清中外泌体circRNAs。取3个健康供体混合血清，分离外泌体RNAs进行RNA-seq，分析人类循环exo-circRNA，共筛选到1215条circRNAs。经Refseq注释分析其分类及长度分布，稳定性试验等，结果显示，人类血清外泌体中包含大量完整和稳定的circRNA 。
图2. 人血液中的外泌体circRNAs分类注释
Li, Y., et al., Circular RNA is enriched and stable in exosomes: a promising biomarker for cancer diagnosis. Cell Res, 2015. 25(8): p. 981-4.
